Ako je to s deltakronom? Slovenský virológ vysvetlil, čo môže znamenať

Svet obletela správa o takzvanom deltakrone, teda novom, údajne zmiešanom variante koronavírusu. Objavili ho na Cypre, pričom testy ho odhalili v 25 prípadoch.

Za objavom stojí tím vedcov Cyperskej univerzity pod vedením profesora biologických vied Leondiosa Kostrikisa, ktorý ho i pomenoval. Netrvalo dlho a objavili sa odborníci, ktorí tvrdia, že ide pravdepodobne o chybu a žiaden deltakron neexistuje.

„Prvotné analýzy ukazujú, že ide o technickú chybu laboratória,“ napísal na Twitteri grécky epidemiológ Gkikas Magiorkinis.

K tomuto názoru sa prikláňa aj slovenský virológ Boris Klempa. Indícií, že je to chyba, je podľa neho viacero a vedecká komunita na ne rýchlo upozornila.

Kontaminované vzorky

Ako hovorí odborník, podľa pôvodnej správy by malo ísť o takzvanú rekombináciu. Je to proces, kedy si dva blízko príbuzné vírusy, ak sa vyskytnú naraz v tej istej bunke, dokážu „vymeniť“ časť ich genetického materiálu. Vznikne teda akýsi „kríženec“.

„Toto je možné a aj popísané u koronavírusov vrátane SARS-CoV-2. V tomto konkrétnom prípade, takzvaného deltrakronu, však všetko nasvedčuje tomu, že k tomuto v skutočnosti vôbec nedošlo a k zdaniu takejto rekombinácie prišlo vplyvom laboratórnej kontaminácie počas procesu sekvenovania vzoriek,“ hovorí Klempa.

Jednoznačne sa prikláňa k scenáru, že ide o chybu. „V skutočnosti taký vírus zatiaľ nebol nájdený. Kompletné vírusové genómy SARS-CoV-2 sa sekvenujú tak, že sa sekvenuje viacero prekrývajúcich sa kratších úsekov a až následne sa z týchto kratších sekvencií, už len počítačovo, vyskladá kompletný genóm,“ približuje.

V tomto procese sa na Cypre stalo, že jeden konkrétny úsek z variantu omikron bol skombinovaný s ostatnými úsekmi z variantu delta.

„Tým vznikol falošný dojem, že ide o spomínanú rekombináciu alebo zjednodušene povedané, že ide o ‚kríženca‘ delty a omikronu, aj keď vznikol len virtuálne,“ hovorí Klempa.

Ťažko dementovať „bombastickú“ správu

Virológ tiež priblížil, že ide o chybu, ktorá sa môže v laboratóriu stať, ale mala by byť odhalená pri výstupnej bioinformatickej analýze.

No a práve túto časť analýzy podľa Klempu cyperské laboratórium podcenilo a zverejnilo „bombastickú“ správu, ktorá sa teraz už ťažko dementuje. Indícií o tom, že to bola chyba, je viacero a vedecká komunita na ne rýchlo upozornila.

Čo by deltakron znamenal, ak by bol skutočným skĺbením delty a omikronu, je možné iba odhadovať. Klempa uvádza, že takáto rekombinácia je teoreticky možná. Nedá sa vylúčiť, že v určitej forme k nej príde, ak sa budú tieto dva varianty niekde aj naďalej vyskytovať súbežne.

„Aké riziko by z toho hrozilo, je v tejto chvíli ťažké špekulovať. Vznikla by nová kombinácia mutácií, ktorá by nemusela byť vôbec výhodná pre vírus, ale aj mohla. V tejto chvíli je to len špekulácia,“ dodáva virológ.